A Série D do Campeonato Brasileiro de Futebol de 2013 será a quinta edição da competição de futebol profissional equivalente à quarta divisão no Brasil. Será disputada por 40 equipes que se classificaram através dos campeonatos estaduais e outros torneios realizados por cada federação estadual. Os jogos terão uma pausa durante a Copa das Confederações de 2013, que será realizada entre junho e julho no Brasil. A competição terá duas rodadas disputadas antes da paralisação. A princípio, a Série D teria 32 clubes, sendo um clube de cada uma das 27 federações, o quinto colocado da edição de 2012 e os quatro rebaixados da Série C de 2012. Porém a CBF voltou atrás, pelo fato das federações já terem feito campeonatos paralelos para a escolha dos participantes, sendo a mudança implementada em 2014. As 40 vagas para a disputa da Série D em 2013 foram distribuídas da seguinte forma:
* Os quatro rebaixados da Série C de 2012;
* Os nove primeiros estados no Ranking Nacional das Federações, divulgado pela CBF, tem direito a dois representantes cada, indicados através do desempenho nos campeonatos estaduais ou outros torneios realizados por cada federação estadual;
* Os demais 18 estados terão um representante cada, indicados através do desempenho nos campeonatos estaduais ou outros torneios realizados por cada federação estadual.
Em caso de desistência, a vaga seria ocupada pelo clube de mesma federação melhor classificado, ou então, pelo clube apontado pela federação estadual. Se o estado não indicasse nenhum representante, a vaga seria repassada ao melhor estado seguinte posicionado no Ranking Nacional das Federações, que indicaria uma equipe a ocupar o mesmo grupo da equipe original. Caso a vaga ainda ficasse em aberto, seria transferida ao segundo estado seguinte e melhor colocado no ranking, sendo assim sucessivamente. O limite de usufruto de vaga repassada é de uma por federação.
Na primeira fase, as 40 equipes estão divididas em 8 grupos de cinco, sendo que os dois primeiros de cada chave avançam para a próxima fase. Em caso de igualdade na pontuação, são critérios de desempate:
1) mais vitórias,
2) melhor saldo de gols,
3) mais gols pró,
4) confronto direto,
5) menos cartões vermelhos,
6) menos cartões amarelos
7) sorteio.
Nas oitavas, quartas, semifinal e final, os times se enfrentam em sistema mata-mata em jogos de ida e volta. Em caso de igualdade de pontos nestas fases, são considerados critérios de desempate: 1) saldo de gols, 2) mais gols marcados no campo do adversário, 3) disputa de pênaltis. Os quatro semifinalistas sobem para a Série C em 2013.
#### 1ª FASE - GRUPOS ####
## GRUPO A1 ##
Nacional Futebol Clube - Manaus (Amazonas)
Náutico Futebol Clube - Boa Vista / Caracaraí (Roraima)
Paragominas Futebol Clube - Paragominas (Pará)
Plácido de Castro Futebol Clube - Plácido de Castro (Acre)
Vilhena Esporte Club - Vilhena (Rondônia)
## GRUPO A2 ##
Gurupi Esporte Clube - Gurupi (Tocantins)
Maranhão Atlético Clube - São Luís (Maranhão)
Parnahyba Sport Club - Parnaíba (Piauí)
Salgueiro Atlético Clube - Salgueiro (Pernambuco)
Ypiranga Clube - Macapá (Amapá)
## GRUPO A3 ##
Associação Esportiva Tiradentes - Fortaleza (Ceará)
Central Sport Club - Caruaru (Pernambuco)
Guarany Sporting Club - Sobral (Ceará)
Sociedade Esportiva Ypiranga Futebol Clube - Santa Cruz do Capibaribe (Pernambuco)
Associação Cultural e Desportiva Potiguar - Mossoró (Rio Grande do Norte)
## GRUPO A4 ##
Botafogo Futebol Clube - João Pessoa (Paraíba)
Club Sportivo Sergipe - Aracaju (Sergipe)
CSA - Centro Sportivo Alagoano - Maceió (Alagoas)
Esporte Clube Primeiro Passo - Vitória da Conquista (Bahia)
Sociedade Desportiva Juazeirense - Juazeiro (Bahia)
## GRUPO A5 ##
Goianésia Esporte Clube - Goianésia (Goiás)
Mixto Esporte Clube - Cuiabá (Mato Grosso)
Esporte Clube Águia Negra - Rio Brilhante (Mato Grosso do Sul)
Associação Atlética Apararecidense - Aparecida de Goiânia (Goiás)
Brasília Futebol Clube - Brasília (Distrito Federal)
## GRUPO A6 ##
Araxá Esporte Clube - Araxá (Minas Gerais)
Esporte Clube Aracruz - Aracruz (Espírito Santo)
Tupi Football Club - Juiz de Fora (Minas Gerais)
Nova Iguaçu Futebol Clube - Nova Iguaçu (Rio de Janeiro)
Resende Futebol Clube - Resende (Rio de Janeiro)
## GRUPO A7 ##
Clube Atlético Penapolense - Penápolis (São Paulo)
Esporte Clube Juventude - Caxias do Sul (Rio Grande do Sul)
Esporte Clube Santo André - Santo André (São Paulo)
Villa Nova Atlético Clube - Nova Lima (Minas Gerais)
Clube Náutico Marcílio Dias - Itajaí (Santa Catarina)
## GRUPO A8 ##
JMalucelli Futebol S.A. - Curitiba (Paraná)
Clube Atlético Metropolitano - Blumenau (Santa Catarina)
Clube Esportivo Lajeadense - Lajeado (Rio Grande do Sul)
Botafogo Futebol Clube - Ribeirão Preto (São Paulo)
Londrina Esporte Clube - Londrina (Paraná)
#### 2ª FASE - OITAVAS DE FINAL ####
* DIAS: 1º e 8 de Setembro *
GRUPO A9 - 1º A1 x 2º A2
GRUPO A10 - 1º A2 x 2º A1
GRUPO A11 - 1º A3 x 2º A4
GRUPO A12 - 1º A4 x 2º A3
GRUPO A13 - 1º A5 x 2º A6
GRUPO A14 - 1º A6 x 2º A5
GRUPO A15 - 1º A7 x 2º A8
GRUPO A16 - 1º A8 x 2º A7
#### 3ª FASE - QUARTAS DE FINAL ####
* DIAS: 15 e 22 de Setembro *
GRUPO A17 - VENC. A9 x VENC. A10
GRUPO A18 - VENC. A11 x VENC. A12
GRUPO A19 - VENC. A13 x VENC. A14
GRUPO A20 - VENC. A15 x VENC. A16
#### 4ª FASE - SEMI FINAIS ####
* DIAS: 29 de Setembro e 6 de Outubro *
GRUPO A21 - VENC. A17 x VENC. A18
GRUPO A22 - VENC. A19 x VENC. A20
#### 5ª FASE - FINAIS ####
* DIAS: 13 e 20 de Outubro *
VENC. A21 x VENC. A22
